いろいろなところにやり方が書いてあるが、情報が古かったりする。
mattintosh.hatenablog.com が一番参考になるが、情報が多すぎて混乱するので必要最小限のことだけまとめておく。
$ wine regedit
でレジストリエディタを起動して、 HKEY_LOCAL_MACHINE -> Software -> Microsoft -> Windows NT -> CurrentVersion -> FontSubstitutes の中の"MS Shell Dlg"を編集、好きなフォントにする。 IPAMonaUIGothicなら問題ないことを確認している(あらかじめMac側にインストールしておくこと)。
フォントを~/.wine/drive_c/windows/Fontsに入れるという記事もあるが、これは不要。
あとは
$ winetricks settings fontsmooth=rgb
が多分必要。 (参考:How do I enable font anti-aliasing in Wine? - Ask Ubuntu)
これで再起動させれば、綺麗になってるはず。
2018/7/28追記
上の設定だけではMSゴシック等が駆逐しきれないことがある。 このあたりを参考にHKEY_CURRENT_USER¥Software¥Wine¥Fonts¥Replacementsの設定をすると良い。